药用制氮机与其他氮气设备不同的是因医药行业国际标准 GMP 标准规定，与药品或药液接触的部分均采用不锈钢材质及除菌方面的要求，设备需要采用不锈钢材质，设备氮气出口部位加装除菌过滤器装置。也因为药厂对设备的总体要求高，通常会有高端配置。药用制氮机通常易于氧化的水针（青霉素等）和大输液（如氨基酸等）都需要冲氮保护，否则药液在保存期里很容易氧化，亦即变质。一般是在封装之前，采用前冲氮后冲氮的方式（或单一冲氮），使得安瓿瓶或输液瓶里的氧气浓度降到 0.5% 以下，药液可长时间保质。就目前来讲，一般厂家购买的制氮机设备大约是 5 -20 m3/h ，纯度为 99.99% 。